在设计的各项建筑物时，应坚固耐用、易于维修、易于清洁，并具备能防止食品、食品接触面及内包装材料遭受污染的结构。与此同时，为防止交叉污染，应分别设置人员通道及物料运输通道，以保证实验的可靠。还须将通向外界的管路、门窗和通风道四周的空隙完全填充，所有通风处应装上防护网。无菌实验室的高度应能满足工艺、卫生要求，以及设备安装、维护、保养的需要。
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